La Biblioteca de la Unibautista es una dependencia de Bienestar Universitario, la cual posee aproximadamente 26.000 ejemplares, que permiten el acceso a la información y al conocimiento. El propósito fundamental de la Biblioteca es apoyar los procesos de investigación, docencia, extensión y aprendizaje de la comunidad universitaria, por medio de los recursos de información disponibles en sus colecciones; así mismo, adquirir, procesar y poner a disposición de los usuarios, la información en el área de Teología que contribuya a la formación académica y profesional.